68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5387 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 283 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  50.87 
 
 		 322 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  54.45 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  53.17 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  33.07 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  37.68 
 
 		 192 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  33.68 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  31.35 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  31.35 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  31.35 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  31.35 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  31.35 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  31.35 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  31.35 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  31.35 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  26.09 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  24.86 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  24.37 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  26.87 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  30.17 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 185 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  29.31 
 
 		 178 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 197 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 177 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  26.19 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 178 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 		 185 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 181 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  30 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 178 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 170 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  26.76 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  33.75 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  32.89 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 169 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  25.97 
 
 		 170 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2869  NUDIX domain-containing protein  38.1 
 
 		 159 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 182 aa  42  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.6 
 
 		 210 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>