More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5084 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  56.37 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  55.51 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  56.64 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  47.41 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  49.32 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  47.51 
 
 		 285 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  44.49 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  44.93 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  44.25 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  42.46 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  38.75 
 
 		 208 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  38.99 
 
 		 204 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  52.55 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 216 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  39.82 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  38.07 
 
 		 212 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  39.91 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  38.01 
 
 		 209 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  38.12 
 
 		 209 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  45.25 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  38.12 
 
 		 209 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  35.32 
 
 		 202 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  35.55 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  49.62 
 
 		 208 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  35.02 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  50 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.8 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  52.94 
 
 		 201 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  49.63 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  51.88 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  50.82 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  33.47 
 
 		 211 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.96 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  47.65 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  32.09 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  41.1 
 
 		 146 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  45.38 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 189 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  35.09 
 
 		 188 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  46.31 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  46.31 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 		 199 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.06 
 
 		 235 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  33.51 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 212 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.36 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 		 197 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  40.13 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  48.44 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  45.04 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  52.54 
 
 		 197 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 		 218 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  48.39 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  50.85 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  30.81 
 
 		 230 aa  99.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 280 aa  99  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  49.23 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 194 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 228 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  41.48 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 		 756 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 		 155 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 202 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  46.4 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.92 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 210 aa  95.9  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.77 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40.31 
 
 		 174 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.52 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.37 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  31.62 
 
 		 233 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 		 195 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 200 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  44.72 
 
 		 438 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 		 154 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  39.23 
 
 		 191 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 195 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  48.74 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  44.03 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 198 aa  92.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  45.3 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 		 187 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>