More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5009 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1181  adenylosuccinate synthetase  90.59 
 
 
458 aa  859  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
458 aa  941  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3162  adenylosuccinate synthetase  86.65 
 
 
458 aa  827  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1101  adenylosuccinate synthetase  90.37 
 
 
458 aa  856  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2296  adenylosuccinate synthetase  84.68 
 
 
458 aa  808  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1883  adenylosuccinate synthetase  82.89 
 
 
446 aa  754  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513447  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2597  adenylosuccinate synthetase  82.96 
 
 
446 aa  746  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  88.6 
 
 
459 aa  852  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  83.81 
 
 
443 aa  790  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  66.3 
 
 
445 aa  628  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  67.78 
 
 
444 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  64.14 
 
 
435 aa  604  1e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  62.86 
 
 
440 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  2.27018e-07 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  63.97 
 
 
446 aa  584  1e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  63.64 
 
 
436 aa  583  1e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  63.76 
 
 
446 aa  582  1e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  64.25 
 
 
446 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  63.96 
 
 
447 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  63.46 
 
 
446 aa  562  1e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  63.82 
 
 
446 aa  563  1e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  63.18 
 
 
448 aa  562  1e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  2.99679e-06 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  62.53 
 
 
432 aa  562  1e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  62.96 
 
 
448 aa  562  1e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  63.16 
 
 
446 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2178  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  62.75 
 
 
448 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  62.75 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  63.18 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  62.75 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  62.75 
 
 
448 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  62.75 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 
448 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  60.57 
 
 
435 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 
448 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1333  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 
448 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2245  adenylosuccinate synthetase  63.18 
 
 
448 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  62.53 
 
 
448 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 
448 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1095  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 
448 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  61.44 
 
 
448 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  8.7591e-07 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  58.44 
 
 
431 aa  542  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 
431 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  58.89 
 
 
430 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  58.63 
 
 
430 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  57.4 
 
 
437 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  58.5 
 
 
432 aa  524  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  57.8 
 
 
438 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  57.96 
 
 
432 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  58.02 
 
 
438 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  58.63 
 
 
430 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  58.54 
 
 
430 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  58.54 
 
 
431 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  57.87 
 
 
429 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  58.31 
 
 
432 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  58.06 
 
 
438 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  58.31 
 
 
430 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  57.96 
 
 
431 aa  517  1e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  58.31 
 
 
430 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  58.31 
 
 
430 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  60.44 
 
 
431 aa  517  1e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  56.22 
 
 
430 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  58.09 
 
 
432 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  57.21 
 
 
430 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  56.44 
 
 
430 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  57.62 
 
 
432 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  56.29 
 
 
432 aa  505  1e-142  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  56.29 
 
 
432 aa  505  1e-142  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  505  1e-142  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  57.87 
 
 
431 aa  508  1e-142  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  56.98 
 
 
431 aa  505  1e-142  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  56.73 
 
 
432 aa  505  1e-142  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  56 
 
 
432 aa  505  1e-142  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  56.07 
 
 
432 aa  504  1e-142  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  57.62 
 
 
432 aa  507  1e-142  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  55.88 
 
 
431 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  57.21 
 
 
431 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1564  Adenylosuccinate synthase  61.4 
 
 
431 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.28883e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1889  adenylosuccinate synthetase  61.4 
 
 
431 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  4.72279e-08 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  55.21 
 
 
430 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  1.95768e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  55.53 
 
 
431 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.76094e-06  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  56.51 
 
 
432 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  55.78 
 
 
431 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
432 aa  494  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  55.65 
 
 
431 aa  494  1e-138  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.10825e-05  hitchhiker  1.53755e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  55.88 
 
 
431 aa  494  1e-138  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  56.29 
 
 
432 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  55.65 
 
 
431 aa  493  1e-138  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  4.89804e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  55.65 
 
 
431 aa  494  1e-138  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>