More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4897 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  66.41 
 
 
259 aa  362  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  66.41 
 
 
259 aa  361  8e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  68.48 
 
 
258 aa  360  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  65.88 
 
 
258 aa  345  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  63.81 
 
 
256 aa  334  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  60.47 
 
 
259 aa  305  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.14 
 
 
257 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.81 
 
 
240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.75 
 
 
257 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.85 
 
 
259 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.27 
 
 
245 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.04 
 
 
259 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.76 
 
 
269 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  50.76 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.51 
 
 
257 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  54.86 
 
 
259 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.43 
 
 
264 aa  255  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.33 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.15 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.08 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.69 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  51.69 
 
 
266 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.19 
 
 
267 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  53.03 
 
 
284 aa  248  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  48.85 
 
 
263 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.12 
 
 
259 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.73 
 
 
259 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  50.39 
 
 
252 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.35 
 
 
250 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.73 
 
 
259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.85 
 
 
257 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.33 
 
 
259 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.26 
 
 
273 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.62 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.69 
 
 
258 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.94 
 
 
258 aa  241  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.94 
 
 
268 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.72 
 
 
252 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.75 
 
 
268 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
250 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.15 
 
 
263 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.66 
 
 
279 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
252 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
268 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
268 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
268 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
268 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  50.37 
 
 
268 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.67 
 
 
279 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  46.72 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  52.65 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.65 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  52.65 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.65 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.26 
 
 
273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.01 
 
 
272 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.33 
 
 
263 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.56 
 
 
251 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.9 
 
 
273 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.33 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.9 
 
 
273 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  52.94 
 
 
255 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.81 
 
 
263 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
251 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  44.44 
 
 
265 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.81 
 
 
268 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.55 
 
 
256 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1602  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
268 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1498  metallo-beta-lactamase family protein  50.37 
 
 
268 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.950921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.62 
 
 
256 aa  228  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
251 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0475  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.02 
 
 
257 aa  227  1e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  47.23 
 
 
267 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0216  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
251 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00257158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0217  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
251 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.950184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0208  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
251 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
251 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
251 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.82 
 
 
295 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.82 
 
 
295 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.74 
 
 
259 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  48.26 
 
 
251 aa  224  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.26 
 
 
251 aa  224  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  48.26 
 
 
251 aa  224  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.57 
 
 
263 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.19 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0909  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.1 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.830211  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.74 
 
 
266 aa  221  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.57 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.26 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0843  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.11 
 
 
223 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.55491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0291  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0305  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0286  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.82 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0299  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
267 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>