38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4838 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  43.24 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.99 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  41.86 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.81 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  37.62 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  36.89 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  36.63 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  37.62 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  37.62 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.63 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  35.64 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  41.18 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.63 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  35.92 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  35.35 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.37 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.37 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.66 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  33 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.79 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  35.64 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.66 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  30 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  34.31 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  34.31 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  40 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  34.31 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  34.65 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  29.41 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  31.31 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  32.04 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>