More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4809 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 475 aa  944    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.49 
 
 		 484 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.54 
 
 		 361 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.44 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.8 
 
 		 411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.25 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.78 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.83 
 
 		 369 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  59.62 
 
 		 168 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.63 
 
 		 154 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  57.06 
 
 		 163 aa  196  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.33 
 
 		 152 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.09 
 
 		 168 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.71 
 
 		 164 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.53 
 
 		 152 aa  190  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  57.49 
 
 		 177 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.77 
 
 		 170 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  56.79 
 
 		 168 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 		 178 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.86 
 
 		 167 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 		 178 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 		 167 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  56.86 
 
 		 178 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 		 178 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 		 178 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  58.9 
 
 		 146 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  56.21 
 
 		 167 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.14 
 
 		 182 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.14 
 
 		 182 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.29 
 
 		 164 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  56.21 
 
 		 167 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.56 
 
 		 162 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  55.56 
 
 		 165 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  60.13 
 
 		 183 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  55.41 
 
 		 172 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  67.12 
 
 		 151 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  55.56 
 
 		 169 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  55.41 
 
 		 172 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  55.41 
 
 		 172 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  55.41 
 
 		 172 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  55.41 
 
 		 172 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.25 
 
 		 189 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.3 
 
 		 175 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.3 
 
 		 175 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  62.5 
 
 		 137 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.3 
 
 		 174 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.79 
 
 		 223 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.3 
 
 		 175 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  59.59 
 
 		 189 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.13 
 
 		 176 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  52.76 
 
 		 222 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 		 187 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.42 
 
 		 231 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  50.91 
 
 		 200 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.13 
 
 		 177 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  50.91 
 
 		 200 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.91 
 
 		 166 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.69 
 
 		 194 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  61.64 
 
 		 205 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  59.46 
 
 		 151 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  55.33 
 
 		 155 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.25 
 
 		 190 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.64 
 
 		 178 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 		 148 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 		 148 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.64 
 
 		 252 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  52.15 
 
 		 222 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.67 
 
 		 169 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.45 
 
 		 142 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  51.97 
 
 		 158 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 182 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.24 
 
 		 167 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 193 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  48.63 
 
 		 161 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  54.97 
 
 		 158 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.85 
 
 		 177 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.33 
 
 		 159 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.14 
 
 		 159 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  51.3 
 
 		 195 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  50.98 
 
 		 165 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.64 
 
 		 158 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.02 
 
 		 197 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  51.01 
 
 		 152 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  62.67 
 
 		 162 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  51.37 
 
 		 159 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.86 
 
 		 193 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.24 
 
 		 187 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.48 
 
 		 159 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  61.48 
 
 		 159 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.48 
 
 		 159 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.48 
 
 		 159 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  50.33 
 
 		 182 aa  160  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  55.63 
 
 		 196 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  53.02 
 
 		 164 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  45.51 
 
 		 160 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  50.98 
 
 		 172 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.27 
 
 		 169 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 		 176 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.25 
 
 		 155 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>