78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4778 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  61.54 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  57.04 
 
 		 288 aa  330  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  58.39 
 
 		 293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  53.76 
 
 		 288 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  44.03 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  43.69 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  44.18 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 		 298 aa  254  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  45 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  48.02 
 
 		 293 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  44.6 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  44.24 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  47.15 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  47.22 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  44.19 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  44.19 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  44.19 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  44.19 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  42.81 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  44.19 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  42.11 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  43.98 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  43.49 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  43.61 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.77 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  42.32 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  43.12 
 
 		 291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  43.46 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  43.46 
 
 		 395 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  43.59 
 
 		 444 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  43.11 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  43.11 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  43.11 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  43.11 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  43.11 
 
 		 486 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  45.56 
 
 		 299 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  43.17 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  43 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.5 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  37.89 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  40.3 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  35.8 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 273 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  33.71 
 
 		 273 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  34.47 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  30.31 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  22.76 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  21.74 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 352 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.32 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.05 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  22.45 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  21.61 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.11 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  22.94 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21.29 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>