More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4756 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.81 
 
 
3470 aa  979    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  42.44 
 
 
2350 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  35.89 
 
 
2174 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  44.96 
 
 
4317 aa  1326    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  42.01 
 
 
5953 aa  861    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.96 
 
 
6889 aa  871    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.63 
 
 
2385 aa  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  45.07 
 
 
4336 aa  1436    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  41.27 
 
 
1104 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  41.39 
 
 
3208 aa  1045    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  41.3 
 
 
2151 aa  1039    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  41.67 
 
 
2875 aa  708    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  40.93 
 
 
1405 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.84 
 
 
5929 aa  723    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  38.01 
 
 
1753 aa  1060    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.79 
 
 
3432 aa  818    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.35 
 
 
4531 aa  877    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.5 
 
 
2385 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.22 
 
 
2385 aa  695    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.34 
 
 
2385 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  50.05 
 
 
4136 aa  932    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  33.14 
 
 
3328 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.27 
 
 
4383 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  35.87 
 
 
3021 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  38.25 
 
 
1370 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  45.52 
 
 
4336 aa  1428    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.86 
 
 
3291 aa  734    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.47 
 
 
4968 aa  768    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  39.95 
 
 
2154 aa  1027    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  43.76 
 
 
2883 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  39.85 
 
 
5328 aa  957    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.67 
 
 
5926 aa  690    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.07 
 
 
9498 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  35.94 
 
 
5372 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.95 
 
 
3395 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.45 
 
 
13537 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.18 
 
 
6676 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  39.3 
 
 
1569 aa  701    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  37.23 
 
 
2867 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  38.67 
 
 
2791 aa  1130    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  36.88 
 
 
1142 aa  680    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.9 
 
 
3308 aa  826    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32.38 
 
 
3498 aa  766    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.43 
 
 
2820 aa  832    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  37.97 
 
 
2033 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  46.18 
 
 
4342 aa  1412    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 
1127 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  27.96 
 
 
2138 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.68 
 
 
8646 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.61 
 
 
2386 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.99 
 
 
6072 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  34.4 
 
 
4572 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  37.01 
 
 
3291 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  42.13 
 
 
5654 aa  754    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  38.54 
 
 
4502 aa  1007    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  40.24 
 
 
1383 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.15 
 
 
5422 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.15 
 
 
4882 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.82 
 
 
3002 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  38.64 
 
 
1369 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  44.6 
 
 
4332 aa  1397    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  35.8 
 
 
6661 aa  733    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.5 
 
 
2385 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  47.85 
 
 
4037 aa  887    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  47.75 
 
 
1138 aa  905    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  48.58 
 
 
1801 aa  1615    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1789 aa  3573    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  37.39 
 
 
3348 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  33.54 
 
 
5620 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  38.95 
 
 
4489 aa  725    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  44.63 
 
 
4317 aa  1319    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  33.74 
 
 
4468 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  32.65 
 
 
3102 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  49.54 
 
 
3432 aa  929    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  46.79 
 
 
6176 aa  848    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.19 
 
 
6081 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 
2125 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.62 
 
 
2370 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  33.5 
 
 
6006 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  37.22 
 
 
2419 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.3 
 
 
3176 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.91 
 
 
4478 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  46.27 
 
 
4342 aa  1421    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  40.88 
 
 
5149 aa  1000    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  36.62 
 
 
2189 aa  843    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  36.13 
 
 
2448 aa  882    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.32 
 
 
8914 aa  765    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.01 
 
 
1816 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  41.88 
 
 
3331 aa  946    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  40.17 
 
 
8915 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  43.16 
 
 
2651 aa  690    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  49.18 
 
 
1130 aa  879    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  53.28 
 
 
1779 aa  1652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  42.11 
 
 
3231 aa  1124    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  41.33 
 
 
3235 aa  1085    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  37.54 
 
 
5230 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  36.38 
 
 
5596 aa  855    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  33.14 
 
 
3352 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  36.55 
 
 
4991 aa  817    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  33.92 
 
 
1833 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>