More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4718 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  436  1e-122  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  85.71 
 
 
218 aa  353  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  85.71 
 
 
218 aa  353  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  85.32 
 
 
219 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  77.17 
 
 
214 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  3.03101e-06 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  76.96 
 
 
210 aa  303  1e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  2.6968e-08  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  79.19 
 
 
217 aa  291  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  75 
 
 
212 aa  287  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  66.01 
 
 
242 aa  283  1e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  67.12 
 
 
219 aa  261  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  59.47 
 
 
218 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  61.4 
 
 
218 aa  233  1e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  9.37501e-05  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  59.91 
 
 
217 aa  233  2e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  66.49 
 
 
218 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  66.49 
 
 
218 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  55.86 
 
 
215 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  55.86 
 
 
215 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  56.76 
 
 
215 aa  222  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  58.47 
 
 
243 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  57.14 
 
 
187 aa  213  3e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  1.42767e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  51.33 
 
 
222 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  51.33 
 
 
222 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  51.33 
 
 
222 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  51.33 
 
 
222 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  51.33 
 
 
222 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  51.33 
 
 
222 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  52.83 
 
 
209 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  52.42 
 
 
224 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.33 
 
 
222 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  52.42 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  52.42 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  52.42 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  52.42 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  52.42 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  48.13 
 
 
188 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  8.29076e-12  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  54.14 
 
 
179 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  54.01 
 
 
232 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  61.94 
 
 
607 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  53.68 
 
 
219 aa  171  6e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  53.68 
 
 
217 aa  171  7e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.62 
 
 
609 aa  141  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  45.45 
 
 
225 aa  139  4e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.77 
 
 
240 aa  129  5e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  47.59 
 
 
227 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  45.7 
 
 
244 aa  120  1e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  44.94 
 
 
363 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.10923e-09  unclonable  2.19993e-07 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  49.18 
 
 
207 aa  115  4e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  54.72 
 
 
241 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  50.38 
 
 
344 aa  113  2e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  3.49757e-05  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  50.38 
 
 
344 aa  113  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  50.38 
 
 
344 aa  113  2e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.17848e-08  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  50.38 
 
 
344 aa  112  4e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  48 
 
 
387 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  49.62 
 
 
345 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  2.81488e-06  decreased coverage  1.76342e-11 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 
239 aa  111  8e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.72 
 
 
237 aa  110  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 
264 aa  110  1e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  5.60377e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.37 
 
 
344 aa  108  4e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  3.00566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.1 
 
 
344 aa  109  4e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.82424e-07  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
231 aa  108  7e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  50.38 
 
 
350 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  50.88 
 
 
209 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  50.38 
 
 
350 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.84221e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  41.73 
 
 
227 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  53.77 
 
 
231 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  48.04 
 
 
241 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 
241 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 
222 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  53.1 
 
 
210 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
239 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.4 
 
 
294 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  51.96 
 
 
266 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  50.94 
 
 
210 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.07187e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  48.09 
 
 
351 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  50.94 
 
 
210 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 
468 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.80584e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  50 
 
 
230 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  44.54 
 
 
224 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  48.15 
 
 
235 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 
213 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  43.08 
 
 
466 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08671e-14 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.74 
 
 
212 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  50.46 
 
 
229 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 
228 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  51.43 
 
 
376 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  1.02046e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 
216 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  1.80513e-08 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
209 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
296 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 
216 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.48 
 
 
209 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
230 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.8 
 
 
346 aa  99.4  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.4176e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  40.8 
 
 
346 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.0212e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  40.8 
 
 
358 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.95857e-08  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  49.06 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  5.54839e-06 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.36 
 
 
294 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  41.6 
 
 
350 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.3965e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>