182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4635 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  100 
 
 
71 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  92.96 
 
 
71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2971  TOBE domain protein  91.55 
 
 
71 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  84.51 
 
 
71 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  81.69 
 
 
71 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  81.69 
 
 
71 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2415  TOBE domain-containing protein  84.29 
 
 
74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  83.1 
 
 
71 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  83.1 
 
 
71 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  83.1 
 
 
71 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  83.1 
 
 
71 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  83.1 
 
 
71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  84.51 
 
 
71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  83.1 
 
 
71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  83.1 
 
 
71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  83.1 
 
 
71 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  81.69 
 
 
71 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  80.28 
 
 
71 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  81.69 
 
 
102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  81.69 
 
 
71 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  81.69 
 
 
71 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  80.28 
 
 
71 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  81.69 
 
 
71 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  81.69 
 
 
71 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  81.69 
 
 
71 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  81.69 
 
 
71 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  77.46 
 
 
71 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4873  molybdenum-pterin binding protein  77.46 
 
 
71 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  77.46 
 
 
71 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  74.65 
 
 
71 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  74.65 
 
 
71 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  74.65 
 
 
71 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  74.65 
 
 
71 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  74.65 
 
 
71 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  74.65 
 
 
90 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  74.65 
 
 
71 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  74.65 
 
 
71 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0618  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  69.01 
 
 
71 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000430997  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0119  molybdenum-pterin binding protein II  75 
 
 
72 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148673  hitchhiker  0.000165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  59.38 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  59.38 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  47.69 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  51.52 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  46.15 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  49.23 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  44.62 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50.77 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  41.54 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1711  hypothetical protein  34.92 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
279 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  40 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
278 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  45.31 
 
 
69 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  37.88 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
279 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  41.18 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  38.46 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  49.15 
 
 
362 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  40 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  41.54 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  38.46 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
276 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
69 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  44.62 
 
 
69 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  41.54 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  37.5 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  41.54 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  45.76 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
278 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  43.94 
 
 
270 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  48.39 
 
 
263 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  44.26 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  38.46 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  36.92 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  39.06 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.1 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  40 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  41.94 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.3 
 
 
140 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  43.75 
 
 
138 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  41.54 
 
 
269 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  40.98 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  38.46 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  37.7 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  41.54 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  44.62 
 
 
378 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  36.92 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  38.71 
 
 
268 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>