203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4569 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 377 aa  733    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  43.32 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  44.05 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  33.88 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 780 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  34.32 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  38.46 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  33.15 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  29.75 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  27.82 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  29.82 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  29.48 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  29.2 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  27.54 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  29.54 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  28.61 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 384 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  29.97 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  29.57 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  28.96 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  25.37 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  26.76 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  26.47 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.47 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  26.74 
 
 		 491 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  27.36 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  25.11 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  25.71 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  27.63 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  21.43 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  28.27 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  25.36 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  26.37 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  22.82 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  25.34 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  24.53 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.28 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  20.61 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  21.8 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  22.92 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  30.06 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.49 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.64 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  25.53 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  29.45 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.54 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.15 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.12 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.01 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  20.66 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  18.96 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  18.94 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.62 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  27.67 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.17 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.29 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>