More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4462 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  78.3 
 
 		 722 aa  1182    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 757 aa  1539    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  70.47 
 
 		 722 aa  999    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  45.67 
 
 		 712 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  47.53 
 
 		 710 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  42.9 
 
 		 701 aa  581  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  43.85 
 
 		 701 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 		 701 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  42.65 
 
 		 701 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  42.65 
 
 		 701 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  42.65 
 
 		 701 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  45.32 
 
 		 703 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  44.65 
 
 		 689 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  39.1 
 
 		 708 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  38.82 
 
 		 703 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.23 
 
 		 713 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  39.2 
 
 		 734 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  39.03 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  38.59 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  39.03 
 
 		 696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 		 692 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 		 715 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 		 702 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 		 724 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 		 702 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 714 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 		 723 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  39.7 
 
 		 703 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  35.98 
 
 		 708 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 		 724 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.55 
 
 		 703 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  39.58 
 
 		 689 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 		 720 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 720 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.2 
 
 		 711 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 		 710 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 720 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 720 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  39.22 
 
 		 738 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 720 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 		 707 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 		 689 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  36.86 
 
 		 736 aa  422  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 732 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 		 741 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 		 714 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 708 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 720 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 		 711 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 		 710 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 730 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.6 
 
 		 709 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  35.79 
 
 		 699 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 715 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 850 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 860 aa  317  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 862 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 815 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 		 859 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 817 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 796 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 730 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 809 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 796 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 796 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 843 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 795 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 795 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 796 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 726 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 726 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 864 aa  287  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 810 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 837 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.7 
 
 		 724 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.49 
 
 		 706 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 721 aa  277  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 825 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 827 aa  276  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 825 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 743 aa  273  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  32.42 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 792 aa  273  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  32.28 
 
 		 713 aa  271  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 719 aa  269  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 707 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 727 aa  260  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 714 aa  260  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 714 aa  260  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 706 aa  257  5e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 677 aa  257  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 742 aa  256  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 881 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 700 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 881 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 882 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>