More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4436 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4436  porin  100 
 
 		 383 aa  773    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0935  OmpC family outer membrane porin  47.18 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000655737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  36.16 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  32.7 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  32.45 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  32.45 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  31.91 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  31.64 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  31.36 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  31.38 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  30.3 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  30.3 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  30.3 
 
 		 389 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  28.21 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  29.33 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  33.64 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  32.11 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  29.33 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  29.33 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  29.33 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  29.33 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  29.23 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.52 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  32.78 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  29.63 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.4 
 
 		 344 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  31.16 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  30.23 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  32.33 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  38.39 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  32.33 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  29.24 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  31.4 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  28.57 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  32.33 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.18 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.02 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  28.09 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  32.05 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  31.91 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  31.38 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  32.05 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  32.05 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.5 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  33.63 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  29.94 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  29.94 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  31.61 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  29.32 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  31.11 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  31.52 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  31.09 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  30.09 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  30.34 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  30.03 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  29.79 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  29.97 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  30.99 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  31.2 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  31.87 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  29.23 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  30.95 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  30.75 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  31.44 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  38.16 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  30.75 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  30.75 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  38.16 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  30.75 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  32.73 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  31.27 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  31.7 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  31.27 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.64 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  31.23 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  27.34 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  29.48 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  39.05 
 
 		 390 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  31.16 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  28.99 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  30.51 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  31.23 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.32 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  32.01 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  30.64 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  32.07 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  32.01 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  30.86 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.32 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  37 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  39.71 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  28.54 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  29.77 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  30.99 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  29.51 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  31.03 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  34.04 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  30.47 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  33.33 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>