More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4432 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  72.09 
 
 		 220 aa  327  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8629  transcriptional regulator, GntR family  62.68 
 
 		 223 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35.89 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0179  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.28 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.84 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.66 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>