More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4421 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
324 aa  670    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  77.54 
 
 
325 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  74.07 
 
 
324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  71.6 
 
 
321 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  70.37 
 
 
321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  62.96 
 
 
321 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  59.57 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  58.72 
 
 
325 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  58.41 
 
 
325 aa  387  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  57.49 
 
 
325 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.66 
 
 
325 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.05 
 
 
325 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.05 
 
 
325 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  55.05 
 
 
325 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.79 
 
 
325 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.79 
 
 
325 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.79 
 
 
325 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.96 
 
 
325 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.35 
 
 
325 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.35 
 
 
325 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.35 
 
 
325 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.05 
 
 
325 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  43.25 
 
 
323 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  42.02 
 
 
360 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.98 
 
 
323 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.98 
 
 
323 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  41.36 
 
 
323 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.26 
 
 
322 aa  258  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.8 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.81 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.38 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.22 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  41.23 
 
 
333 aa  242  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  38.17 
 
 
345 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7673  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.81 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.690652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.27 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1843  Mg2+/Co2+ transporter  38.27 
 
 
323 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.84 
 
 
417 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3867  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.27 
 
 
323 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1910  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.75 
 
 
334 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1452  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.35 
 
 
323 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.786219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.27 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1874  Mg2+ transporter protein, CorA-like  37.65 
 
 
323 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.24 
 
 
327 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2064  magnesium and cobalt transport protein, putative  36.73 
 
 
323 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00816438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.09 
 
 
324 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.26 
 
 
358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
404 aa  225  7e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.56 
 
 
326 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.87 
 
 
340 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.72 
 
 
323 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.5 
 
 
368 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1742  Mg2+ transporter protein, CorA-like  35.49 
 
 
323 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  39.08 
 
 
337 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.08 
 
 
337 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  35.67 
 
 
372 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.67 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.93 
 
 
365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.46 
 
 
374 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.55 
 
 
367 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  37 
 
 
353 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  37 
 
 
353 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  37 
 
 
353 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.35 
 
 
436 aa  215  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  34.06 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.74 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.4 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5093  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.06 
 
 
347 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  hitchhiker  0.0090718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.28 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5376  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.06 
 
 
347 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.904617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.73 
 
 
367 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  33.64 
 
 
363 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.02 
 
 
380 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.94 
 
 
361 aa  205  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  35.76 
 
 
384 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.46 
 
 
357 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.78 
 
 
378 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.87 
 
 
322 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  35.45 
 
 
366 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.38 
 
 
323 aa  198  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4484  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.93 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0841  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.82 
 
 
324 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1832  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.1 
 
 
346 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.99 
 
 
375 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  33.91 
 
 
380 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.93 
 
 
358 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.29 
 
 
338 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.76 
 
 
330 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.29 
 
 
338 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4998  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.92 
 
 
381 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442957  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.34 
 
 
322 aa  185  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.65 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
354 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.5 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.75 
 
 
339 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13880  Mg2+/Co2+ transporter  33.43 
 
 
330 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00247267  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.73 
 
 
391 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.76 
 
 
354 aa  176  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.87 
 
 
322 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.82 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>