29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4399 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4399  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  235  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0749  hypothetical protein  83.33 
 
 		 166 aa  196  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  81.65 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5346  hypothetical protein  80.36 
 
 		 112 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  81.65 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  48.94 
 
 		 683 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  53.85 
 
 		 254 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  52.94 
 
 		 640 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 393 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  50 
 
 		 642 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.36 
 
 		 615 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  50 
 
 		 644 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 394 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  50 
 
 		 642 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  40.43 
 
 		 388 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  50 
 
 		 642 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  50 
 
 		 388 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  50 
 
 		 388 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 393 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  43.14 
 
 		 664 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  37.5 
 
 		 645 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  41.67 
 
 		 394 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  41.67 
 
 		 394 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  44.68 
 
 		 647 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  47.5 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  46.51 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  35.09 
 
 		 632 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  42.5 
 
 		 643 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>