117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4397 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  66.31 
 
 
189 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  64.36 
 
 
189 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  61.7 
 
 
190 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  60.75 
 
 
190 aa  225  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  62.96 
 
 
188 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  61.83 
 
 
188 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  61.93 
 
 
178 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  59.79 
 
 
190 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  58.06 
 
 
190 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  58.6 
 
 
189 aa  215  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  59 
 
 
232 aa  215  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  59.14 
 
 
188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  59.14 
 
 
188 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  59.14 
 
 
188 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  59.14 
 
 
188 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  59.14 
 
 
188 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  56.45 
 
 
190 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  58.95 
 
 
191 aa  201  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  58.06 
 
 
189 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  58.06 
 
 
189 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  58.06 
 
 
189 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  59.28 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  56.91 
 
 
188 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  55.56 
 
 
185 aa  187  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  53.93 
 
 
196 aa  181  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  60.75 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  53.93 
 
 
194 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  52.36 
 
 
194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  41.88 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  40.11 
 
 
201 aa  124  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  39.78 
 
 
190 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  42.78 
 
 
188 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  36.02 
 
 
189 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  42.27 
 
 
193 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  43.14 
 
 
213 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  42.79 
 
 
213 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  47.15 
 
 
193 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  40.86 
 
 
186 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  38.17 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  38.17 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  40.86 
 
 
185 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  41.18 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  41.08 
 
 
184 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  40.78 
 
 
179 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  44.44 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  44.5 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  33.33 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  37.97 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  44.62 
 
 
188 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  41.18 
 
 
190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  36.02 
 
 
187 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  36.02 
 
 
187 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  36.02 
 
 
187 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  35.14 
 
 
193 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  38.38 
 
 
188 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  37.77 
 
 
186 aa  99  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  36.26 
 
 
185 aa  98.2  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  34.91 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  35.83 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  37.3 
 
 
187 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  35.23 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  29.95 
 
 
181 aa  97.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  40.72 
 
 
190 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  34.59 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  35.56 
 
 
194 aa  95.5  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  35.37 
 
 
184 aa  95.1  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  35.26 
 
 
189 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  34.43 
 
 
182 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  35 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  32.49 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.992365 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4106  hypothetical protein  51.65 
 
 
94 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  31.69 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  31.49 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  33.52 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  32.61 
 
 
185 aa  79  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  31.32 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  34.29 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  31.91 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  33.53 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  36.36 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  33.16 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  30.34 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  33.15 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5502  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  30.34 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000039704  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5024  integral membrane protein  29.78 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>