More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4365 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1398 aa  2815  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  45.16 
 
 
1311 aa  1022  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  35.95 
 
 
1353 aa  559  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  34 
 
 
1349 aa  556  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
1348 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
1403 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  34.28 
 
 
1349 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  34.28 
 
 
1349 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 
1342 aa  540  1e-152  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  35.87 
 
 
1359 aa  542  1e-152  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  35.92 
 
 
1359 aa  540  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  35.84 
 
 
1350 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  35.84 
 
 
1359 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
1359 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  35.84 
 
 
1359 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
1402 aa  537  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  34.84 
 
 
1213 aa  486  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  36.2 
 
 
956 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
1105 aa  328  4e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 
1048 aa  312  3e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.33 
 
 
1122 aa  306  2e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 
1043 aa  278  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
1037 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.52 
 
 
1065 aa  259  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
1046 aa  254  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.61 
 
 
1055 aa  245  4e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 
1377 aa  239  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.25277e-08 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  47.35 
 
 
1818 aa  230  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.71 
 
 
1149 aa  228  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 
1148 aa  227  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  25.85 
 
 
1358 aa  225  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.52 
 
 
1175 aa  225  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 
1227 aa  218  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.55 
 
 
1151 aa  216  2e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 
1151 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.6 
 
 
1141 aa  209  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  24.75 
 
 
1139 aa  197  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.63 
 
 
1117 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.33 
 
 
664 aa  181  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 
1138 aa  180  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.55 
 
 
647 aa  178  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.93 
 
 
681 aa  176  4e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.4 
 
 
692 aa  175  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.76 
 
 
666 aa  174  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
700 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
691 aa  172  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.98 
 
 
1291 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.24 
 
 
668 aa  167  1e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.25 
 
 
676 aa  165  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 
647 aa  164  8e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  40.36 
 
 
519 aa  164  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.22 
 
 
1087 aa  162  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  24.28 
 
 
1133 aa  161  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.91 
 
 
1134 aa  161  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.76 
 
 
635 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.72 
 
 
551 aa  161  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
678 aa  159  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
612 aa  160  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 
750 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  34.82 
 
 
620 aa  159  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
612 aa  159  5e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 
524 aa  159  5e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  36.7 
 
 
656 aa  159  5e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
624 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
624 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.13 
 
 
621 aa  158  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
624 aa  158  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  36.9 
 
 
626 aa  158  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  34.92 
 
 
625 aa  158  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  38.83 
 
 
618 aa  158  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
703 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
707 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.34 
 
 
1014 aa  157  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
582 aa  156  3e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.31 
 
 
869 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.84 
 
 
1023 aa  155  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.78 
 
 
584 aa  155  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
502 aa  154  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.96 
 
 
627 aa  154  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 
615 aa  154  9e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  36.84 
 
 
625 aa  154  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.18 
 
 
700 aa  154  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  37.46 
 
 
625 aa  154  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 
1027 aa  154  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 
1027 aa  154  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2648  serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 
578 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0958386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
1027 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.3 
 
 
1126 aa  153  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 
613 aa  153  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  38.21 
 
 
736 aa  153  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.74 
 
 
1403 aa  153  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.31 
 
 
681 aa  152  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
776 aa  152  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  42.91 
 
 
675 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  37.14 
 
 
597 aa  152  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
657 aa  152  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.32 
 
 
863 aa  152  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.58 
 
 
657 aa  152  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.15 
 
 
798 aa  152  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
690 aa  152  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>