276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4353 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 430 aa  867    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  71.46 
 
 		 425 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  70.5 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  70.5 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  47.29 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  43.87 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  46 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  43.47 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  43.09 
 
 		 422 aa  303  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  40.67 
 
 		 419 aa  299  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  41.24 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  41.41 
 
 		 428 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.66 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 		 409 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  38.04 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.06 
 
 		 412 aa  256  6e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  37.75 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  37.53 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.71 
 
 		 447 aa  242  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.5 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  38.88 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  38.78 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  36.26 
 
 		 427 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.89 
 
 		 412 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  36.02 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.75 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.94 
 
 		 422 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  32.52 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  36.21 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  36.97 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  36.08 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  35.85 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  36.75 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.98 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  34.43 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.83 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.41 
 
 		 430 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  34.53 
 
 		 411 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  35.87 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.03 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  36.2 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.46 
 
 		 430 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  34.71 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  32.28 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  35.02 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  37.01 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.77 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.77 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 		 414 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.02 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  36.19 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  36.56 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  36.67 
 
 		 427 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.65 
 
 		 416 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 		 408 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  34.69 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  36.1 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  34.92 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  35.87 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.28 
 
 		 416 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  37.83 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  36.26 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  34.69 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  37.59 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  34.36 
 
 		 419 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  35.97 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 407 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  33.88 
 
 		 416 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  35.34 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  36.96 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  35.81 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  35.08 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  35.88 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.95 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  35.52 
 
 		 426 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>