137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4323 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  296  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  64.9 
 
 
172 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  64.2 
 
 
176 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  68.75 
 
 
172 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  57.86 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  65.94 
 
 
172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  56.29 
 
 
184 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  47.79 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  47.79 
 
 
156 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  51.33 
 
 
172 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  49.39 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  47.59 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  44.97 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  48.2 
 
 
151 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  42.86 
 
 
148 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  41.55 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  43.48 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  38.4 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  40.71 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  41.55 
 
 
148 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  41.96 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  40.43 
 
 
148 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  38.85 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  41.18 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  37.61 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  42.42 
 
 
132 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  35.21 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  29.5 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  42.75 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  32.37 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  36.03 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  35.51 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  38.66 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  38.1 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  37.32 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  35.34 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  37.7 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  37.3 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  39.72 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  34.06 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  33.81 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  39.67 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  37.86 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  37.86 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.08 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  36.96 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  37.41 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  36.84 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  31.03 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  34.03 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  34.75 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  35.97 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  36.36 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  37.96 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  32.62 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  31.91 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  35.07 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  32.41 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  34.53 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  34.53 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  33.57 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  31.39 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  28.47 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  31.39 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  31.39 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  37.97 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  30.61 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.13 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  29.93 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  37.36 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  34.31 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  33.86 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  31.06 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  37.18 
 
 
144 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  38.03 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  33.87 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  37.97 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  57.8  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  34.56 
 
 
147 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  35.9 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  35.9 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  30.41 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  35.9 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  30.22 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  36.71 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.28 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  26.43 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  27.78 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  24.48 
 
 
309 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  24.48 
 
 
309 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  28.48 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  26.62 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  37.18 
 
 
146 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  29.53 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  25 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  34.57 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>