185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4312 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  100 
 
 		 294 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  87.37 
 
 		 293 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  87.03 
 
 		 295 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  87.29 
 
 		 295 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  76.87 
 
 		 298 aa  447  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  75.17 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  74.83 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  74.83 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  74.83 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  80.27 
 
 		 296 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  80.61 
 
 		 296 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  76.53 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  75.85 
 
 		 298 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  75.85 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  75.85 
 
 		 298 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  75.85 
 
 		 298 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  75.85 
 
 		 298 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  75.85 
 
 		 298 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  75.85 
 
 		 298 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  76.19 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  74.15 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  75.09 
 
 		 302 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  75.09 
 
 		 302 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  76.19 
 
 		 296 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  73.7 
 
 		 303 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  67.35 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  62.29 
 
 		 299 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  62.29 
 
 		 299 aa  341  8e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  59.73 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  60 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  58.84 
 
 		 300 aa  318  7.999999999999999e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  53.06 
 
 		 299 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  55.36 
 
 		 294 aa  295  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  55.36 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  55.71 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 292 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  57.84 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  56.45 
 
 		 292 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  52.61 
 
 		 294 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 295 aa  275  8e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  50 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  49.66 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  53.12 
 
 		 329 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  49.83 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 306 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  46.55 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  46.65 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  49.49 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  47.93 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  48.81 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  45.97 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  46.6 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  46.45 
 
 		 640 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.36 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.75 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.58 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  34.99 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.75 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  42.22 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.85 
 
 		 584 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 363 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  56.12 
 
 		 120 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  23.59 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  24.62 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 365 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  24.15 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  23.08 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4770  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  28.36 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  22.57 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  27.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  27.07 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  30.43 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  25.56 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  25.88 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  25.88 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  25.88 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  30.26 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1973  inner-membrane translocator  29.95 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>