61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4301 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 339 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  47.77 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  38.97 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  39 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  36.83 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  36.23 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  36.23 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  34.42 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  35.93 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  33.53 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  33.83 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  34.29 
 
 		 843 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 		 313 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 383 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  33.23 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  33.23 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  34.02 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  32.94 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  32.64 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31.91 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.78 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 361 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  26.69 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.07 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  27.61 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  29.39 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  29.09 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.1 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  27.27 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  28.22 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  27.57 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  28.66 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  27.16 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.84 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.22 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  25 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  23.23 
 
 		 439 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0996  hypothetical protein  18.26 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>