93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4271 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  358  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  69.32 
 
 		 192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  67.58 
 
 		 185 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  67.58 
 
 		 196 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  67.58 
 
 		 196 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  67.42 
 
 		 185 aa  243  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 183 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  65.59 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  65.59 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  59.09 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  51.96 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  51.72 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  51.72 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  53.14 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  42.16 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  39.16 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 195 aa  98.2  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 190 aa  90.9  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  30.61 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  30.29 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  40.2 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  32.06 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  35.22 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  40.4 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  29.71 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  27.41 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  30.63 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  26.54 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  34.43 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  31.01 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  33.33 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  26.88 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 325 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1864  hypothetical protein  25.45 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00461724  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  34.17 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  32.97 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  27.01 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  29.36 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  32.86 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  29.41 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  28.16 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  26.26 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.67 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  29.67 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  30.23 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  28.72 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 178 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 227 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>