More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4237 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  100 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  50 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  53.85 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  40.43 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  44.83 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  39.49 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  36.15 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 208 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  47.12 
 
 		 217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  47.37 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  42.77 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  39.77 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  39.77 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  45.66 
 
 		 213 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 208 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  41.18 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  37.89 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  39.18 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  41.18 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  44.22 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  42.69 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  36.7 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  36.32 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  35.48 
 
 		 199 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  38.51 
 
 		 200 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  37.19 
 
 		 205 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 206 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  36.67 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  37.19 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  36.87 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  36.96 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  38.82 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  36.87 
 
 		 240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  38.42 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  37.02 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  33.69 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  39.2 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 202 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  37.11 
 
 		 202 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.43 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  38.29 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.29 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  37.57 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  37.57 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  40 
 
 		 219 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  37.22 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.2 
 
 		 207 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  40 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.87 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.87 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  40 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.87 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.87 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  38.55 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 205 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.02 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  36.17 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.34 
 
 		 206 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  37.14 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  34.91 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  39.11 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  38.55 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  39.01 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  38.55 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  35.88 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  37.36 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  35.34 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  37.78 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  38.55 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  35.06 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  37.43 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  36.21 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  38.55 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  38.55 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  38.55 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>