More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4048 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 407 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  56.25 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  55.98 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  59.77 
 
 		 369 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  52.76 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  52.29 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  34.9 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  35.47 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  35.92 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 341 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  35.78 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  32.95 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  33.91 
 
 		 328 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  32.46 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  32.94 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  31.94 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  31.64 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  32.03 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  31.94 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 329 aa  116  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  30.35 
 
 		 843 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  32.1 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  28.07 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  29.75 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.36 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  27.14 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  22.76 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  27.76 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.82 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  26.82 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.69 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  23.85 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  35.78 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  36.79 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  36.79 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  63.41 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  34.86 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  35 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  34 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  36.7 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  34.58 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  36.89 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  32.02 
 
 		 316 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  37 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  51.11 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  46.15 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  25.99 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  40.91 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  32.06 
 
 		 484 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  36.36 
 
 		 481 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  36.36 
 
 		 481 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  35.85 
 
 		 485 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  37.66 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  36 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  47.17 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  36.54 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  33.03 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  46.55 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  36.13 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  33.96 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  55 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  41.56 
 
 		 491 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.54 
 
 		 502 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  45.1 
 
 		 502 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  45.1 
 
 		 502 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.54 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  38.14 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  33.02 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.54 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  35.37 
 
 		 498 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  53.49 
 
 		 493 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  48.28 
 
 		 532 aa  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  35.29 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  56.1 
 
 		 502 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  44.62 
 
 		 519 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  31.53 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 524 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>