More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4040 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  66.97 
 
 
571 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  68.34 
 
 
580 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  68.16 
 
 
580 aa  704    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  100 
 
 
586 aa  1141    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  70.05 
 
 
574 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  58.73 
 
 
581 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  38.65 
 
 
584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  39.06 
 
 
588 aa  299  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  39.34 
 
 
571 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  31.31 
 
 
626 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.1 
 
 
585 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  32.95 
 
 
571 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  36.31 
 
 
572 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  29.34 
 
 
711 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.52 
 
 
591 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  30.91 
 
 
584 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.82 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  29.58 
 
 
603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.7 
 
 
585 aa  230  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  32.13 
 
 
588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  31.27 
 
 
578 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  30.69 
 
 
588 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  29.71 
 
 
608 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  32.49 
 
 
583 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  30.04 
 
 
711 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  31.81 
 
 
577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.41 
 
 
574 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  34.5 
 
 
558 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  29.44 
 
 
703 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  31.84 
 
 
590 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.87 
 
 
586 aa  213  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  32.97 
 
 
592 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  33.39 
 
 
605 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  30.76 
 
 
573 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  31.84 
 
 
730 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  29.14 
 
 
703 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  30.02 
 
 
620 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2936  sulphate transporter  33.96 
 
 
508 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  31.24 
 
 
603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  30.56 
 
 
580 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  29.48 
 
 
560 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  26.18 
 
 
573 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  37.1 
 
 
694 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  27.42 
 
 
597 aa  187  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  38.49 
 
 
708 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  31.07 
 
 
521 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  28.23 
 
 
570 aa  183  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  28.18 
 
 
570 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2470  sulphate transporter  33.02 
 
 
706 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.760506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  30.94 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  30.87 
 
 
599 aa  180  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  28.32 
 
 
569 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0985  sulphate transporter  37.5 
 
 
710 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  32.34 
 
 
620 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  28.32 
 
 
569 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  28.83 
 
 
584 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  33.33 
 
 
736 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  31.26 
 
 
521 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  31.4 
 
 
522 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  29.98 
 
 
583 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  31.23 
 
 
517 aa  173  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  35.48 
 
 
708 aa  173  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  28.34 
 
 
585 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  29.61 
 
 
574 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  32.8 
 
 
690 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  30.71 
 
 
595 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.66 
 
 
579 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  30.26 
 
 
546 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  29.34 
 
 
590 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  30.62 
 
 
521 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2640  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.13 
 
 
703 aa  170  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  31.24 
 
 
582 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  28.37 
 
 
585 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  28.54 
 
 
585 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2336  sulfate transporter  35.28 
 
 
703 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0246739  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  30.81 
 
 
590 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  30.67 
 
 
517 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  30.23 
 
 
563 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.71 
 
 
578 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  31.1 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  30.76 
 
 
592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  30.9 
 
 
590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  33.02 
 
 
698 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  28.54 
 
 
590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  28.37 
 
 
585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  31.09 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.29 
 
 
596 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  28.17 
 
 
585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  28.17 
 
 
585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  30.29 
 
 
588 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  28.17 
 
 
585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  28.17 
 
 
585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  25.05 
 
 
580 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  26.97 
 
 
600 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  27.55 
 
 
575 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  29.46 
 
 
573 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  27.76 
 
 
729 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1857  sulphate transporter  35.37 
 
 
702 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.249315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  30.36 
 
 
582 aa  157  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  26.97 
 
 
565 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>