32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3973 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  659  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  45.09 
 
 
347 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  41.45 
 
 
347 aa  215  1e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  41.45 
 
 
347 aa  215  1e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  46.34 
 
 
176 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  29.3 
 
 
371 aa  77.8  3e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  29.68 
 
 
365 aa  75.1  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  28.76 
 
 
396 aa  75.1  2e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  32.51 
 
 
359 aa  74.3  3e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  28.63 
 
 
355 aa  70.5  4e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  29.82 
 
 
399 aa  68.6  1e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  32.57 
 
 
431 aa  67.4  3e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  29.39 
 
 
425 aa  67  5e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  31.05 
 
 
375 aa  66.6  6e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  31.74 
 
 
378 aa  65.5  1e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  34.02 
 
 
388 aa  64.7  2e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  33.5 
 
 
395 aa  65.1  2e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  33.04 
 
 
379 aa  65.1  2e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  30.53 
 
 
375 aa  64.3  3e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  28.99 
 
 
378 aa  61.2  2e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  26.55 
 
 
367 aa  60.1  5e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  29.61 
 
 
373 aa  57.8  3e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.57468e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  28.44 
 
 
419 aa  55.8  1e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.07578e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  27.38 
 
 
347 aa  54.3  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  26.88 
 
 
443 aa  52.4  1e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  29.79 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  24.46 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  35 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  27.82 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  25.24 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  30.28 
 
 
427 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  29.41 
 
 
415 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>