37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3847 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  42.48 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  31.76 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  35.92 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  33.96 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  33.96 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.86 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  35.25 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  32.79 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  32.79 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  34.9 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.14 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  35.25 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  26.32 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  35.25 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.54 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  27.75 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  37.89 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  39.53 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  28.51 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  40.23 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  26.89 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  37.93 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.63 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  37.5 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  30.95 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  34.17 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  29.29 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  38.14 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.11 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  33.65 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  33.05 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  25.83 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  33.65 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  31.52 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  29.03 
 
 		 302 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>