More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3828 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
392 aa  797    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  68.42 
 
 
390 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  65.65 
 
 
382 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  64.82 
 
 
382 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 
370 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 
375 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
375 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
377 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
406 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  40.31 
 
 
393 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.35 
 
 
393 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
402 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
404 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2109  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
408 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
405 aa  229  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  38.22 
 
 
378 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.2 
 
 
544 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
587 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  31.52 
 
 
374 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  44.1 
 
 
387 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  30.61 
 
 
528 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  44.59 
 
 
471 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6238  histidine kinase  34.69 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547868  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
572 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 
507 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2260  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
557 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
356 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  30.93 
 
 
396 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  54.73 
 
 
341 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  40.5 
 
 
306 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
405 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
621 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  40.99 
 
 
405 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  40.99 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
618 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  40.54 
 
 
405 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
396 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
595 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  39.17 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1029  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.040723  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  37.82 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  28.24 
 
 
667 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  37.82 
 
 
373 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
912 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  36.03 
 
 
380 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  36.36 
 
 
371 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  36.65 
 
 
373 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  35.83 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.35 
 
 
716 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
424 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  36.29 
 
 
410 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
372 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.63 
 
 
680 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  40.08 
 
 
403 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.9 
 
 
707 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.864356  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
373 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.34 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  35.68 
 
 
728 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  32.54 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1645  hypothetical protein  46.58 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  35.51 
 
 
383 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  35.12 
 
 
728 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
734 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0184  response regulator receiver protein  52.21 
 
 
210 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3722  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.89 
 
 
727 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  35.62 
 
 
376 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
373 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5008  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50 
 
 
708 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100946  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
524 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
524 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  36.16 
 
 
447 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  33.86 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 
712 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.31 
 
 
1152 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  34.23 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.55 
 
 
708 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0400  response regulator receiver protein  49.31 
 
 
210 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.83 
 
 
708 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
712 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.6651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
348 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
712 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 
1691 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
442 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>