More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3782 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  42.51 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 290 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 214 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 214 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  98.6  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.42 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 235 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.81 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.81 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.44 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.44 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.84 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.44 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.44 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 267 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  29.85 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  43.31 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 207 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.89 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  33.89 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  42 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>