More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3744 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
491 aa  965    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  52.03 
 
 
480 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.3 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  43.44 
 
 
519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.83 
 
 
483 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.51 
 
 
509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  48.9 
 
 
493 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  45.58 
 
 
489 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.11 
 
 
504 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.25 
 
 
517 aa  348  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.96 
 
 
517 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.85 
 
 
514 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 
498 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 
498 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 
498 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 
498 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
514 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
514 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
498 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
493 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.93 
 
 
498 aa  299  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
498 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
498 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 
498 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
498 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.93 
 
 
527 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.85 
 
 
515 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.72 
 
 
502 aa  296  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38 
 
 
502 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  47.25 
 
 
556 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  37.3 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  37.3 
 
 
502 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  37.04 
 
 
533 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.19 
 
 
502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.34 
 
 
490 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  35.36 
 
 
496 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  37.07 
 
 
504 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.17 
 
 
490 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.58 
 
 
504 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  40.09 
 
 
505 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.12 
 
 
489 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.93 
 
 
699 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.63 
 
 
474 aa  250  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  38.35 
 
 
492 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  38.28 
 
 
475 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.07 
 
 
515 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  37.27 
 
 
483 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.16 
 
 
604 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  38.6 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  36.72 
 
 
514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.45 
 
 
509 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  37.34 
 
 
585 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  37.34 
 
 
594 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  37.34 
 
 
615 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  37.45 
 
 
601 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.88 
 
 
499 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  33.86 
 
 
496 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  35.93 
 
 
504 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.78 
 
 
498 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.86 
 
 
552 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  37.13 
 
 
593 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  37.13 
 
 
576 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  37.13 
 
 
582 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  37.13 
 
 
582 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.05 
 
 
529 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.16 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.03 
 
 
509 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.82 
 
 
509 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.92 
 
 
543 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.12 
 
 
505 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.9 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.68 
 
 
483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.21 
 
 
702 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.66 
 
 
515 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 
499 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  35.4 
 
 
498 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.89 
 
 
482 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  34.02 
 
 
484 aa  220  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.19 
 
 
509 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.7 
 
 
487 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  33.68 
 
 
488 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.08 
 
 
478 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.08 
 
 
478 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.08 
 
 
478 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3114  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.2 
 
 
475 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.08 
 
 
478 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  31.87 
 
 
478 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03952  predicted outer membrane factor of efflux pump  34.1 
 
 
488 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3912  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.1 
 
 
488 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4325  putative outer membrane efflux protein MdtP  34.1 
 
 
488 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3947  putative outer membrane efflux protein MdtP  34.1 
 
 
488 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03912  hypothetical protein  34.1 
 
 
488 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4637  putative outer membrane efflux protein MdtP  34.1 
 
 
488 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.46 
 
 
494 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 
629 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4544  putative outer membrane efflux protein MdtP  33.89 
 
 
488 aa  203  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0905  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.28 
 
 
478 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.601202  normal  0.184806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2273  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.07 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1509  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.07 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37 
 
 
488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268118  normal  0.678051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>