More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3706 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3706  patatin  100 
 
 		 348 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  80.17 
 
 		 346 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  66.37 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  63.61 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  63.58 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  67.67 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  63.94 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  52.81 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  51.35 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  52.51 
 
 		 293 aa  271  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  51.27 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  49.66 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  50.19 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  49.82 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  49.82 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  49.82 
 
 		 347 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  49.82 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  49.01 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  48.36 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  48.35 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  47.06 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  47.42 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  49.22 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  49.41 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  49.41 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  49.41 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  49.22 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  48.34 
 
 		 358 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  49.02 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  48.63 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  49.82 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  49.82 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  48.8 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  46.64 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  48.99 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  47.43 
 
 		 301 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  42.47 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  42.97 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  42.59 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  42.59 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  37.97 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  40.54 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  36.19 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  39.6 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  36.54 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.77 
 
 		 275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  49.42 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  40 
 
 		 250 aa  159  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.52 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.92 
 
 		 256 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  33.98 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  36.43 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  36.43 
 
 		 263 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  36.43 
 
 		 263 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  36.43 
 
 		 263 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  36.43 
 
 		 263 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  36.05 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  36.43 
 
 		 263 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  36.43 
 
 		 263 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  34.25 
 
 		 263 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.43 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  37.37 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.41 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.02 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  33.67 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  44.39 
 
 		 216 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  35.02 
 
 		 263 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  35.71 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  34.54 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.84 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  37.16 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.73 
 
 		 751 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  36.21 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  34.21 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  35.17 
 
 		 728 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.09 
 
 		 727 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.85 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  33.88 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.83 
 
 		 728 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  34.77 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  34.42 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.12 
 
 		 733 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  35.83 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  39.39 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  34.55 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  33.56 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  32.27 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.45 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  33.55 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  33.6 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.67 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  44.02 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  33.46 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.28 
 
 		 760 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.75 
 
 		 728 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  41.21 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  41.21 
 
 		 301 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  35.83 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  41.21 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  41.21 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>