More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3680 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3680  porin  100 
 
 		 366 aa  713    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  39.16 
 
 		 414 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  38.9 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  37.62 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  39.84 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  36.91 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  38.03 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  39.13 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  37.63 
 
 		 349 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  37.12 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  35.29 
 
 		 362 aa  170  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  37.27 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  35.81 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  36.49 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  35.65 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  36.36 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  36.39 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  34.17 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  34.05 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  34.06 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  35.58 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  33.24 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  34.02 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  32.22 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.69 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  32.8 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  35.8 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  33.88 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  34.73 
 
 		 352 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  34.73 
 
 		 352 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  30.98 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.43 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  33.98 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.14 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  31.08 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  29.89 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  29.89 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  31 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  34.1 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  31.06 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.77 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  33.73 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.98 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  31.31 
 
 		 359 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  31.59 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.72 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.62 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.62 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.77 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.62 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.21 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  31.59 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.21 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.21 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  30.02 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  32.33 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  31.97 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  30.12 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  33.98 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  29.41 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.64 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  29.09 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  29.89 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  31.4 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  29.27 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  30.17 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.75 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.08 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.09 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  30.3 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.49 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.61 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.61 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  27.81 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  30.43 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  30.19 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  28.95 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  27.81 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  29.87 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30.99 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  29.53 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  29.01 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  30.61 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  29.17 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  30.4 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  29.17 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  29.17 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  27.85 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  30.81 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  29.17 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  29.17 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  29.17 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  29.17 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  30.48 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  29.74 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  30.72 
 
 		 387 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  29.92 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  29.92 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.71 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  28.68 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>