188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3629 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  100 
 
 
309 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  32.33 
 
 
340 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  31.67 
 
 
344 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  30.67 
 
 
344 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  32.03 
 
 
333 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  31.46 
 
 
383 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  30.23 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  29.67 
 
 
344 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  31 
 
 
340 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  29.84 
 
 
337 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  31.13 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  27.55 
 
 
335 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  31.01 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  30.52 
 
 
342 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  29.55 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  31.83 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  31.01 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  28.12 
 
 
353 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  26.67 
 
 
351 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  27.74 
 
 
336 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  28.57 
 
 
327 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  25.5 
 
 
354 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  26.77 
 
 
367 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  27.42 
 
 
356 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  25.66 
 
 
367 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  28.05 
 
 
348 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  26.54 
 
 
354 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  29.25 
 
 
356 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  29.32 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  27.39 
 
 
363 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  29.22 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  24.14 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  27.01 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  28.57 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  34.55 
 
 
384 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  24.68 
 
 
351 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  23 
 
 
382 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  27.8 
 
 
364 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  25.16 
 
 
366 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  24.51 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  24.66 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  26.62 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.09 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  23.75 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  29.3 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  25.64 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  22.43 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  28.18 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  26.21 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  22.43 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  24.5 
 
 
391 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  26.6 
 
 
383 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  26.4 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  25.07 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.35 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  24.68 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  26.42 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  33.33 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.62 
 
 
616 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  36.13 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  31.69 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  24.78 
 
 
598 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  26.89 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  26.6 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  23.2 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  33.07 
 
 
389 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  30.43 
 
 
349 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  23.38 
 
 
403 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  23.64 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  29.88 
 
 
360 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.67 
 
 
657 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.49 
 
 
657 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  23.08 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  26.81 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  23.58 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  21.88 
 
 
379 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  27.55 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  26.18 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  26.14 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  22.29 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  21.88 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  24.84 
 
 
637 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  26.77 
 
 
369 aa  57  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  32.54 
 
 
243 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.19 
 
 
658 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  23.1 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  22.73 
 
 
350 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  28.84 
 
 
584 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  26.65 
 
 
675 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  26.99 
 
 
603 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  26.99 
 
 
603 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  26.87 
 
 
658 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  27.41 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  26.51 
 
 
656 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.38 
 
 
660 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  25.62 
 
 
671 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  26.09 
 
 
385 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  23.43 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  22.69 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  27.96 
 
 
603 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>