More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3575 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  100 
 
 
514 aa  985    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  64.65 
 
 
500 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  66.1 
 
 
500 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  60.66 
 
 
495 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  64.07 
 
 
501 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  65.37 
 
 
501 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  56.33 
 
 
500 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  59.91 
 
 
504 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  54.41 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  50.57 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  48.88 
 
 
594 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 
523 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  46.09 
 
 
513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  42.52 
 
 
533 aa  326  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
501 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  47.77 
 
 
501 aa  323  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  46.17 
 
 
517 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  43.2 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  43.2 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  43.2 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  46.24 
 
 
510 aa  316  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
510 aa  307  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  39.67 
 
 
495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  39.67 
 
 
495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  39.67 
 
 
495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  39.67 
 
 
495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  39.67 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.5 
 
 
537 aa  302  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  40.29 
 
 
494 aa  300  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
528 aa  297  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  42.32 
 
 
535 aa  296  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  44.81 
 
 
528 aa  296  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
511 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 
509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 
588 aa  286  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
555 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 
518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
524 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 
513 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
516 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
508 aa  279  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
562 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  40.04 
 
 
517 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  41.24 
 
 
554 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 
524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  38.61 
 
 
528 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
516 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  42.19 
 
 
584 aa  273  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 
490 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
521 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 
529 aa  267  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.08 
 
 
525 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 
503 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.96 
 
 
505 aa  262  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  40.72 
 
 
508 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  39.16 
 
 
509 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  37.68 
 
 
514 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  38.99 
 
 
526 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  38.23 
 
 
509 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
513 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
539 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  38.96 
 
 
540 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  38.54 
 
 
558 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 
541 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 
477 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
496 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  38.68 
 
 
532 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  38.1 
 
 
509 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
535 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
519 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
506 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
536 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 
532 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 
516 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 
510 aa  247  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
501 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  38 
 
 
536 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
553 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 
513 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 
516 aa  240  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
521 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.68 
 
 
503 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  39.29 
 
 
481 aa  236  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  39.78 
 
 
563 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  38.09 
 
 
601 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  37.5 
 
 
575 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 
502 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 
534 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 
607 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  36.88 
 
 
492 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  37.22 
 
 
519 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.86 
 
 
522 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 
538 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 
478 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 
519 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
507 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 
486 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 
486 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>