More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3566 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3566  asparaginase  100 
 
 
318 aa  624  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188072  hitchhiker  0.00798524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2559  asparaginase/glutaminase  50.61 
 
 
325 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0847476  normal  0.0141583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2993  asparaginase  47.79 
 
 
341 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4896  asparaginase  50.16 
 
 
356 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.970044  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  51.26 
 
 
323 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  47.78 
 
 
316 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  50.63 
 
 
323 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1919  asparaginase  45.62 
 
 
321 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2637  Asparaginase  49.84 
 
 
329 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2081  asparaginase  44.65 
 
 
309 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.438459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  46.29 
 
 
338 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  44.59 
 
 
346 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1865  asparaginase  45.27 
 
 
315 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  42.55 
 
 
355 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  43.22 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  44.2 
 
 
367 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  42.32 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  42.01 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  41.61 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  41.23 
 
 
340 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  44.44 
 
 
330 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  43.53 
 
 
330 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  41.61 
 
 
365 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  41.61 
 
 
365 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  40.99 
 
 
347 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  42.14 
 
 
347 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  42.14 
 
 
347 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  42.14 
 
 
347 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  42.14 
 
 
396 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  42.14 
 
 
347 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  42.14 
 
 
347 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  42.14 
 
 
347 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  36.94 
 
 
348 aa  182  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  37.38 
 
 
356 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  37.07 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  37.07 
 
 
352 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  37.07 
 
 
352 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  36.28 
 
 
344 aa  179  7e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  42.96 
 
 
333 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  45.23 
 
 
378 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  36.28 
 
 
346 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  36.68 
 
 
348 aa  168  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  34.38 
 
 
348 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  38.58 
 
 
339 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  36.36 
 
 
348 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  34.78 
 
 
347 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  35.96 
 
 
346 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  35.94 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  35.53 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  34.49 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  36.04 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  33.97 
 
 
338 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  34.58 
 
 
354 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  34.89 
 
 
352 aa  158  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  35.56 
 
 
348 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  34.88 
 
 
348 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  36.01 
 
 
379 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  36.65 
 
 
373 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  36.65 
 
 
366 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  36.64 
 
 
331 aa  155  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  36.36 
 
 
348 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  34.57 
 
 
347 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  34.57 
 
 
347 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  34.06 
 
 
347 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  34.26 
 
 
347 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  34.57 
 
 
347 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  34.57 
 
 
347 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  35.55 
 
 
345 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4206  L-asparaginases, type II  34.63 
 
 
356 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  36.54 
 
 
345 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  36.54 
 
 
345 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  34.85 
 
 
348 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4182  L-asparaginases, type II  36.04 
 
 
365 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428323  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  33.88 
 
 
348 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  33.88 
 
 
348 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2339  Asparaginase  37.34 
 
 
352 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0564  L-asparaginase, type II  35.34 
 
 
378 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  33.96 
 
 
375 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  35.44 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  33.55 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0801  Asparaginase  38.34 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  40.28 
 
 
330 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  33.55 
 
 
348 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  33.55 
 
 
348 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  33.55 
 
 
348 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  33.55 
 
 
348 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  34.3 
 
 
374 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  33.55 
 
 
348 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  39.44 
 
 
327 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  32.35 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5349  L-asparaginase, type II  37.46 
 
 
372 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5042  L-asparaginase, type II  36.75 
 
 
369 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  32.87 
 
 
330 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>