More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3535 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
326 aa  665  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  88.5 
 
 
313 aa  582  1e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  88.82 
 
 
313 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  88.82 
 
 
313 aa  579  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  85.62 
 
 
313 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  79.23 
 
 
313 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  77.07 
 
 
314 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  77.07 
 
 
314 aa  507  1e-142  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  75.39 
 
 
317 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  80.44 
 
 
317 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  74.84 
 
 
321 aa  481  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  58.47 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 
313 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 
313 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 
313 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  58.47 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  58.47 
 
 
313 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  58.15 
 
 
313 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  57.83 
 
 
313 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  58.1 
 
 
313 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 
313 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 
313 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 
313 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  56.55 
 
 
313 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  57.78 
 
 
313 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 
313 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  56.55 
 
 
313 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  53.99 
 
 
313 aa  356  3e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  52.36 
 
 
308 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
308 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
308 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
308 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
308 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
308 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
308 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
308 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  52.01 
 
 
308 aa  319  4e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  51.68 
 
 
308 aa  319  4e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  51.68 
 
 
308 aa  319  4e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  52.01 
 
 
308 aa  318  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  52.01 
 
 
308 aa  318  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  52.29 
 
 
311 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  52.19 
 
 
308 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  50 
 
 
309 aa  315  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  51.34 
 
 
308 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  50.96 
 
 
313 aa  313  2e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  51.01 
 
 
308 aa  313  3e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  51.01 
 
 
308 aa  313  3e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  50.67 
 
 
308 aa  311  7e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
312 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  49.34 
 
 
314 aa  304  2e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.79611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  47.73 
 
 
319 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  45.28 
 
 
324 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  44.95 
 
 
324 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  47.7 
 
 
326 aa  299  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  44.95 
 
 
324 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  47.4 
 
 
319 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  44.95 
 
 
324 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  43.97 
 
 
324 aa  298  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  45.95 
 
 
324 aa  298  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91923e-06 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  50 
 
 
312 aa  298  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  47.4 
 
 
327 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  44.63 
 
 
324 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  44.3 
 
 
324 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  1.99307e-11 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  44.3 
 
 
324 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  44.3 
 
 
324 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  4.6762e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  43.97 
 
 
324 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42013e-07 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  47.9 
 
 
316 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  44.95 
 
 
324 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  47.56 
 
 
308 aa  295  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  48.85 
 
 
354 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  46.38 
 
 
311 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  1.24662e-06 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
314 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  48.03 
 
 
315 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
308 aa  292  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  50.82 
 
 
314 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  46.1 
 
 
323 aa  291  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  43.95 
 
 
335 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  47.33 
 
 
306 aa  289  5e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  46.45 
 
 
320 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  46.45 
 
 
320 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  43.61 
 
 
325 aa  284  1e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 
320 aa  283  2e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  44.59 
 
 
324 aa  283  2e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  43.09 
 
 
324 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  43.45 
 
 
313 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  42.76 
 
 
324 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  47.68 
 
 
316 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.65107e-08  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  41.31 
 
 
324 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  47.35 
 
 
316 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.01541e-08  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1200  transcriptional regulator CysB  44.08 
 
 
324 aa  275  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01793  transcriptional regulator CysB  41.64 
 
 
324 aa  275  1e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 
309 aa  274  1e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>