104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3529 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 409 aa  803    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 		 356 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  32.62 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  28.95 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  33.04 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 361 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  33.22 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  26.51 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.6 
 
 		 470 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.85 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  26.76 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  24.68 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  28.08 
 
 		 587 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  29.81 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.41 
 
 		 506 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.7 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  28.4 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  20.4 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  23.89 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.16 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  20.75 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.52 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.73 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  20.75 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.14 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  20.75 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  23.22 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.47 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.47 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.28 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.84 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.23 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  23.08 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.18 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.99 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  26.61 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.56 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  20.9 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  26.61 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  26.61 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  25 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  27.8 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  21.01 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  20.59 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  22.39 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  20.27 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  23.3 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  23.01 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  20.9 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  20.74 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  27.16 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  19.94 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  25.3 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  23.64 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  23.65 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  22.02 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  21.83 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  21.15 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  24.71 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  28.37 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  28.36 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  20.06 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  22.16 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  24.66 
 
 		 507 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  22.73 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  26.45 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  20.17 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  21.27 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  20.92 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  23.39 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  23.06 
 
 		 647 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  26.51 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  18.51 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  19.66 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 344 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.27 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.36 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  24.16 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  25.89 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  20.05 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>