More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3521 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  88.7 
 
 
239 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  88.7 
 
 
239 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  84.1 
 
 
239 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  80.17 
 
 
241 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2683  hypothetical protein  83.68 
 
 
241 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0166157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4238  hypothetical protein  81.17 
 
 
239 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1337  hypothetical protein  80.75 
 
 
241 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2075  hypothetical protein  80.75 
 
 
244 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.967436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1728  hypothetical protein  79.08 
 
 
241 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.359816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1967  hypothetical protein  77.41 
 
 
243 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445597  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  70.71 
 
 
239 aa  362  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  69.87 
 
 
241 aa  361  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  67.51 
 
 
240 aa  347  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  65.56 
 
 
243 aa  340  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  68.35 
 
 
242 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  67.36 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  68.35 
 
 
242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  68.35 
 
 
242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  68.35 
 
 
242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  68.78 
 
 
242 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4067  hypothetical protein  64.56 
 
 
241 aa  334  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751245  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  68.35 
 
 
242 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  66.95 
 
 
242 aa  334  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  67.93 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  66.24 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2064  hypothetical protein  65.69 
 
 
242 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  64.14 
 
 
241 aa  321  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  66.24 
 
 
241 aa  321  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0785  hypothetical protein  64.56 
 
 
241 aa  321  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356846  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  63.71 
 
 
241 aa  317  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  63.71 
 
 
241 aa  317  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  63.6 
 
 
248 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  60.25 
 
 
250 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  60.25 
 
 
248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  58.16 
 
 
248 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  57.74 
 
 
250 aa  287  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  57.74 
 
 
250 aa  287  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  57.98 
 
 
244 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  57.98 
 
 
244 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  57.74 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  55 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  62.76 
 
 
249 aa  278  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  56.07 
 
 
248 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  55.65 
 
 
248 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  55.65 
 
 
248 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  55.65 
 
 
248 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  55.65 
 
 
248 aa  275  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  56.49 
 
 
248 aa  275  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  55.65 
 
 
247 aa  274  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  56.49 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  56.85 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  54.39 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  56.07 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  56.25 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  55.23 
 
 
248 aa  272  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  55.65 
 
 
248 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  55.65 
 
 
248 aa  272  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  55.23 
 
 
248 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  55.23 
 
 
248 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  56.49 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  54.81 
 
 
247 aa  271  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  54.39 
 
 
247 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  55.65 
 
 
248 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  54.81 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  53.97 
 
 
247 aa  271  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  56.07 
 
 
247 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  56.9 
 
 
246 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  56.9 
 
 
246 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  56.9 
 
 
246 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  56.9 
 
 
246 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  59.83 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  55.23 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  56.07 
 
 
246 aa  268  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  56.07 
 
 
246 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  56.07 
 
 
246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  54.81 
 
 
248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  268  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  268  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  56.49 
 
 
246 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  53.56 
 
 
248 aa  267  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  53.14 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  52.72 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  55.23 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3128  hypothetical protein  62.55 
 
 
243 aa  265  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  265  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  53.97 
 
 
247 aa  265  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>