More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3356 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3356  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 441 aa  876    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00269891  normal  0.865177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 430 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1176  enolase  67.39 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0192586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  65.22 
 
 		 427 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  63.18 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 425 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  61.05 
 
 		 427 aa  522  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  63.18 
 
 		 425 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  63.18 
 
 		 425 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  62.47 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  61.85 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 		 426 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  61.05 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  61.05 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 		 425 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  61.14 
 
 		 425 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  61.85 
 
 		 424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  60.33 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  61.61 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  60.81 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  61.41 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  62.32 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  63.57 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  58.61 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  58.81 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  61.52 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  59.48 
 
 		 425 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  58.29 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  60.95 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  58.53 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  61.06 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  56.44 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  58.21 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  56.87 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  58.43 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  57.38 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  56.9 
 
 		 428 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  56.67 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  58.03 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  55.82 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  58.29 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  56.8 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  58.41 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  58.65 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  57.62 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  56.9 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  56.97 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  55.87 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  58.63 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  57.14 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  61.19 
 
 		 428 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  60.56 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  57.35 
 
 		 426 aa  475  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  58.96 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  56.1 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  57.35 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  60.1 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  57.14 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  56.1 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  55.79 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  58.67 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  56.12 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  58.29 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  58.02 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  57.52 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  55.24 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  59.2 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  59.2 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  57.31 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  57.62 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  56.53 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  55.92 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  58.02 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  57.72 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  58.71 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  55.32 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  55.32 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0339  phosphopyruvate hydratase  57.59 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  57.14 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  57.14 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  57.72 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  58.1 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.47463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>