More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3312 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  86.58 
 
 		 231 aa  417  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  86.58 
 
 		 231 aa  417  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  85.96 
 
 		 235 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  90.04 
 
 		 231 aa  407  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  83.12 
 
 		 231 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  82.25 
 
 		 231 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  80.95 
 
 		 231 aa  390  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  78.35 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  70.64 
 
 		 236 aa  347  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  69.53 
 
 		 237 aa  338  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  67.81 
 
 		 237 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.24 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  67.81 
 
 		 239 aa  331  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  68.24 
 
 		 239 aa  330  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  65.53 
 
 		 235 aa  320  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  62.34 
 
 		 232 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  62.34 
 
 		 231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  61.47 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  61.9 
 
 		 231 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  61.04 
 
 		 241 aa  294  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  60.09 
 
 		 238 aa  286  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  60.7 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  56.22 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  54.94 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.36 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  51.52 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.22 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.22 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 231 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  50.65 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  50.65 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  50.22 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.62 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.62 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.04 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.16 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  50.65 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.26 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.28 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.53 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.47 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  44.4 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.26 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.2 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.2 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.4 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.83 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  43.78 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.53 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  42.79 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  43.72 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  44.44 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  41.2 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  44.59 
 
 		 239 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  45.71 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.26 
 
 		 235 aa  197  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  44.64 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.81 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  43.51 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  42.06 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.84 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  46.67 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  43.28 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  43.04 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  42.61 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  42.72 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  43.72 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  43.04 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  42.02 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  46.19 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  42.49 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>