225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3302 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1037    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  68.09 
 
 		 495 aa  653    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  65.85 
 
 		 494 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  71.46 
 
 		 498 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  68.29 
 
 		 495 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  66.4 
 
 		 476 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  64.72 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  64.97 
 
 		 496 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  64.4 
 
 		 497 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  58.1 
 
 		 507 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  58.28 
 
 		 503 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  54.13 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  54.28 
 
 		 529 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  53.77 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  54.47 
 
 		 529 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  54.62 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  54.4 
 
 		 518 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  54.42 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  54.42 
 
 		 525 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  53.33 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  54.42 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  54.42 
 
 		 525 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  53.94 
 
 		 518 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  54.42 
 
 		 525 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  54.42 
 
 		 521 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  52.84 
 
 		 522 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  52.84 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  52.84 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  53.63 
 
 		 525 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  53.93 
 
 		 544 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  54.22 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  53.35 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  53.15 
 
 		 522 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  53.35 
 
 		 522 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  52.95 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  53.82 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  47.81 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  48.91 
 
 		 492 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  49.17 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  49.17 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  48.77 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  49.18 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  49.38 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  48.56 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  48.77 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  48.48 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  48.77 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  48.28 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  48.48 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  48.28 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  45.07 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  48.28 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  48.48 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  48.28 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  48.87 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  47.88 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  47.47 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  47.27 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  47.47 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  47.47 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  47.47 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  46.6 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  45.04 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  46.8 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  44.14 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  47.79 
 
 		 487 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  45.95 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  45.95 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  45.21 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  45.21 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  45.21 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  44.94 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  46.09 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  45.75 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  45.27 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  45.14 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  46.28 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  46.73 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  45.38 
 
 		 486 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  45.89 
 
 		 486 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3659  hypothetical protein  44.74 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  44.94 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  44.74 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0308  hypothetical protein  44.33 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0254223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  46.39 
 
 		 487 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  44.74 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  45.53 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  44.53 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  42.57 
 
 		 522 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  45.18 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  42.17 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  44.64 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  46.18 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  43.61 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2514  hypothetical protein  43.09 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0407  hypothetical protein  42.94 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  45.58 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  44.67 
 
 		 521 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  45.27 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  45.03 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>