136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3295 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  74.02 
 
 		 158 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  74.02 
 
 		 158 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  42.18 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  29.5 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  34.56 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  29.27 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  32.84 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  33.59 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  30.43 
 
 		 410 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  31.16 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  30.43 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  27.82 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  29.71 
 
 		 469 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.03 
 
 		 616 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.76 
 
 		 751 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  32.06 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  30.43 
 
 		 422 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  29.71 
 
 		 414 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  29.71 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  29.71 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  29.71 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  32.31 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  29.71 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  28.12 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  23.94 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  32.03 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  28.28 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  31.71 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  31.71 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  33.58 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  30.89 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  32.41 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.39 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  29.92 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  27.56 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  27.88 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  30.71 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  25.71 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  30.14 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  30.71 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  30.57 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  26.49 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  30.97 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  31.01 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  42.37 
 
 		 625 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  32.33 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  31.48 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  31.48 
 
 		 310 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  28.23 
 
 		 204 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  30.71 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.68 
 
 		 907 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  31.03 
 
 		 245 aa  51.6  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  29.58 
 
 		 311 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  30.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  30.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  30.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  28.35 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  30.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  25.19 
 
 		 556 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  29.92 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  27.2 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  37.04 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  33.7 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  29.63 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.69 
 
 		 474 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.68 
 
 		 448 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  30.08 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  23.13 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  28.19 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  28.67 
 
 		 292 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 		 348 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  28.87 
 
 		 310 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  29.71 
 
 		 292 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  27.54 
 
 		 284 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  28.57 
 
 		 297 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  36.76 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  36.76 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.39 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.13 
 
 		 580 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  23.13 
 
 		 579 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  28.78 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  23.13 
 
 		 598 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  22.22 
 
 		 536 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  23.13 
 
 		 582 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  30 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  23.13 
 
 		 582 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  25.45 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 		 476 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  24.63 
 
 		 575 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  22.6 
 
 		 676 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 348 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  28.03 
 
 		 564 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_002620  TC0285  hypothetical protein  27.12 
 
 		 446 aa  44.7  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0121761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  28.03 
 
 		 564 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  27.71 
 
 		 391 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  28.03 
 
 		 564 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>