More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3282 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
410 aa  806    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  54.95 
 
 
409 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.44 
 
 
392 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  55.53 
 
 
407 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  49.88 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  51.52 
 
 
387 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  50.12 
 
 
390 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  50.5 
 
 
391 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  50.25 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.14 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.3 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  43.75 
 
 
384 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  51.02 
 
 
569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.57 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  42.75 
 
 
414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  47.04 
 
 
445 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  43.73 
 
 
414 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  42.42 
 
 
408 aa  255  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  42.15 
 
 
408 aa  253  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.6 
 
 
410 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  39.48 
 
 
415 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  40.95 
 
 
391 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  40.05 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  40 
 
 
435 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  40 
 
 
428 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  39.85 
 
 
399 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  39.58 
 
 
385 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  40.25 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  40.25 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  40.25 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  36.72 
 
 
428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.04 
 
 
393 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  38.44 
 
 
383 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  39.5 
 
 
420 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 
399 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  38.18 
 
 
405 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  39.29 
 
 
393 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 
409 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  36.62 
 
 
370 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  36.62 
 
 
370 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  36.19 
 
 
416 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  36.36 
 
 
370 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  35.56 
 
 
401 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  35.56 
 
 
401 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  37.34 
 
 
416 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  35.56 
 
 
401 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  37.43 
 
 
416 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.06 
 
 
397 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.08 
 
 
410 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 
416 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  37.16 
 
 
382 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  37.16 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  34.75 
 
 
430 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 
393 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 
371 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  35.01 
 
 
371 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  34.22 
 
 
399 aa  192  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  35.01 
 
 
371 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.75 
 
 
399 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  35.01 
 
 
371 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.59 
 
 
387 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  35.01 
 
 
371 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  35.01 
 
 
371 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  35.01 
 
 
371 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  35.01 
 
 
371 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  34.68 
 
 
372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  35.09 
 
 
405 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  34.68 
 
 
372 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  34.68 
 
 
372 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  34.68 
 
 
372 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  35.01 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  32.42 
 
 
406 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  34.43 
 
 
372 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 
406 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.25 
 
 
398 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.75 
 
 
396 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  37.15 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  29.62 
 
 
390 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  31.69 
 
 
456 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  32.51 
 
 
455 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  34.66 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  37.06 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  36.46 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  35.4 
 
 
371 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  29.79 
 
 
390 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  35.75 
 
 
389 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  36.55 
 
 
394 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  29.69 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  30.16 
 
 
397 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  29.4 
 
 
402 aa  169  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 
396 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  28.43 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  30.23 
 
 
394 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 
402 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  30.77 
 
 
394 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.5 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  32.98 
 
 
403 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.98 
 
 
430 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  30.05 
 
 
412 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>