18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3253 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3253  KilA domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  533  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000473609  decreased coverage  0.00000000000000635561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1028  hypothetical protein  40.88 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.604601  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  49.43 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4450  KilA-N domain family  47.62 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000955205  unclonable  0.00000000145542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2280  KilA-N domain-containing protein  39.84 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0187873  decreased coverage  1.7596300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2154  KilA-N domain family  44.44 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000036696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1718  hypothetical protein  64.15 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000662496  unclonable  0.0000000124796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  36.89 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0561  KilA domain-containing protein  34.15 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0630  KilA-N domain family  34.38 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  hitchhiker  0.00000226954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2898  KilA-N domain protein  34.38 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.892571  hitchhiker  0.0000000704164 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  48.65 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  48.65 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  48.65 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3223  KilA domain protein  27.84 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  51.43 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  40.54 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  45.71 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>