75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3065 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  54.72 
 
 		 230 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  57.67 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  56.6 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  58.29 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  54.25 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  47.32 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  40.66 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  32.63 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  35.78 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  34.87 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  34.08 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  34.02 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  37.74 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  30.36 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  26.99 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  35.62 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  32.64 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  31.41 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  32.64 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  32.64 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  33.16 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  33.16 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  36.05 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  37.93 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  32.61 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  27.39 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  26.29 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  31.25 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  37.04 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  28.02 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  27.68 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  29.73 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  30.22 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  28.48 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  31.72 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  28.24 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  26.02 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  25.65 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  24.88 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  27.45 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  37.23 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  37.04 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2262  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.98 
 
 		 795 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.283733 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  38.24 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1709  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.68 
 
 		 795 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.67 
 
 		 824 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.68 
 
 		 795 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0237  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  37.76 
 
 		 798 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.68 
 
 		 795 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1312  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.54 
 
 		 803 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1005  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.91 
 
 		 818 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.19 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 		 834 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1761  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.35 
 
 		 805 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.83 
 
 		 795 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.71 
 
 		 820 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.067961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0407  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.35 
 
 		 805 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0065  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.58 
 
 		 812 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.145265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  29.17 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 795 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2469  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.49 
 
 		 795 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.55 
 
 		 795 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 		 795 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.83 
 
 		 795 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.83 
 
 		 795 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>