209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3022 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  73.37 
 
 
193 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  70.49 
 
 
186 aa  278  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  69.95 
 
 
187 aa  275  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  72.83 
 
 
193 aa  274  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  50.55 
 
 
186 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.92 
 
 
187 aa  167  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.8 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  48.4 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.99 
 
 
179 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  41.08 
 
 
180 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.02 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.03 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.4 
 
 
177 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.51 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  41.34 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  42.86 
 
 
173 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.8 
 
 
185 aa  121  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  31.64 
 
 
173 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  30.9 
 
 
174 aa  97.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.67 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  30.34 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.78 
 
 
174 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.72 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.94 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.81 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  30.34 
 
 
173 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  30.34 
 
 
173 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  29.21 
 
 
173 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  30.34 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  32.02 
 
 
172 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.3 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  35.16 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  33.52 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.62 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  29.12 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  35.71 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  24.59 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.7 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.87 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  35.23 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.76 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.41 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  32.91 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  34.24 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  35.33 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.81 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  33.69 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  34.54 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  31.01 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.53 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  31.89 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.4 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  25 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  28.48 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  31.45 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  30.82 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  31.01 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.12 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.11 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  29.7 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.68 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  29.02 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  28.73 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.31 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  28.73 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.04 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  30.05 
 
 
194 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
193 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.86 
 
 
178 aa  57.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.74 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>