More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2998 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  100 
 
 
363 aa  738    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  79.83 
 
 
363 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  79.28 
 
 
363 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3378  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  75.14 
 
 
363 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2744  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  72.47 
 
 
370 aa  492  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.662947  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  62.33 
 
 
394 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2139  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  65.01 
 
 
380 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000311215  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2006  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  62.77 
 
 
375 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  56.2 
 
 
360 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  54.27 
 
 
383 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  53.89 
 
 
369 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  53.06 
 
 
414 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  52.33 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50.8 
 
 
374 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  49.47 
 
 
376 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  48.53 
 
 
376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.81 
 
 
356 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.51 
 
 
368 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  41.5 
 
 
352 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  41.38 
 
 
352 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.51 
 
 
356 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.76 
 
 
360 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.67 
 
 
370 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  44.63 
 
 
357 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.63 
 
 
357 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.25 
 
 
346 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.36 
 
 
379 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1833  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.37 
 
 
380 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1244  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.62 
 
 
380 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.877663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1985  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.62 
 
 
380 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1729  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.62 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0387  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.62 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0775  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.62 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.79 
 
 
356 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1482  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.89 
 
 
386 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328933  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1816  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.62 
 
 
380 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.521456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1461  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.5 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
383 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1672  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.09 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.949523  normal  0.128117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2504  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.07 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4702  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.19 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
352 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1560  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.46 
 
 
387 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1080  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.46 
 
 
387 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.11 
 
 
355 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1536  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.67 
 
 
387 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 
350 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
353 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.21 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.84 
 
 
354 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
356 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.38 
 
 
365 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
379 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.05 
 
 
379 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  43.64 
 
 
365 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.11 
 
 
379 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 
348 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.11 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.07 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.39 
 
 
352 aa  236  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 
345 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.92 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.79 
 
 
383 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.13 
 
 
350 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.79 
 
 
383 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
379 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
379 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.7 
 
 
347 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.13 
 
 
390 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 
344 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.34 
 
 
350 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 
429 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.44 
 
 
351 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.32 
 
 
351 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.73 
 
 
351 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.03 
 
 
351 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.03 
 
 
351 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.42 
 
 
351 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.87 
 
 
417 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.88 
 
 
351 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.03 
 
 
351 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.03 
 
 
351 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 
374 aa  222  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.93 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.74 
 
 
350 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
334 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 
376 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.5 
 
 
350 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.78 
 
 
350 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.3 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.3 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.3 
 
 
382 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
376 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.86 
 
 
357 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.49 
 
 
357 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.06 
 
 
391 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
390 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>