More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2768 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.92 
 
 		 251 aa  351  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.92 
 
 		 253 aa  331  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.91 
 
 		 252 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.65 
 
 		 253 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.42 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  50.4 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  48.61 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.25 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  28.85 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.92 
 
 		 659 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.84 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.73 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.12 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.68 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.34 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.43 
 
 		 651 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.44 
 
 		 661 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.51 
 
 		 662 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.6 
 
 		 662 aa  105  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  27.89 
 
 		 663 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.11 
 
 		 662 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 		 463 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0699041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.24 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.24 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.69 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  28.97 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  29.48 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  28.69 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.2 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  27.91 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.64 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  27.8 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  27.24 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  30.12 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>