More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2767 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  64.95 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  43.14 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  43.14 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  44.66 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  41 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  38.12 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  38.42 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 218 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  37.75 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  37.62 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  39.38 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1255  regulatory protein GntR, HTH  61.95 
 
 		 122 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  36.26 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>